رسالت دانشکده داروسازی زنجان تربیت داروسازان و محققان متخصص،متعهد و آگاه به نیازهای جامعه برای ارائه خدمات مؤثر به نظام سلامت است. این دانشکده با تلفیق آموزش نظری،پژوهش‌های کاربردی و مهارت‌های عملی،در نظر دارد دانشجویان را برای ایفای نقش فعال در طراحی،تولید،ارزیابی داروها و ارائه خدمات دارویی توانمند سازد.ارتقای کیفیت درمان دارویی بیماران و فراهم آوردن دسترسی آن‌ها به داروهای ایمن و مؤثر از اهداف اصلی این مجموعه می باشد. تمرکز پژوهش‌های دانشکده بر طراحی و ارزیابی سیستم‌های نوین دارورسانی،ارزیابی سمیت داروها،تولید داروهای نوترکیب و مشتقات جدید دارویی و بهره‌گیری از ظرفیت گیاهان دارویی و ترکیبات طبیعی و ارائه مراقبتهای دارویی در بخش های بالینی است. این فعالیت‌های تحقیقاتی با هدف توسعه درمان‌های نوآورانه،افزایش اثربخشی داروها و کاهش عوارض جانبی انجام می‌شود.همچنین،دانشکده با همکاری صنایع دارویی،مراکز تحقیقاتی و بیمارستان‌ها،در تلاش است تا به بهبود فرآیند درمان و ارتقای سلامت جامعه کمک ‌کند.بنابراین رسالت این دانشکده گسترش مرزهای دانش داروسازی و خدمت به انسان از طریق ارتقاء شاخص های بهداشتی جامعه است.